Фамилия Пересечанский — одна из тех, что сразу указывает на географию. Её основа — топоним Пересечное или Пересеча. Такие названия встречаются на западе и юго-западе бывшей Российской империи: например, село Пересечное под Харьковом, а также Пересеча в Галиции (ныне Львовская область Украины). Человек, получивший эту фамилию, скорее всего, был выходцем из одного из этих мест, либо владел землёй в той местности.

Суффикс -ский типичен для польской и западнорусской шляхетской традиции. В Речи Посполитой фамилии на -ский носили дворяне, указывая на родовое поместье: «из Пересечного» — Пересечанский. После разделов Польши и вхождения земель в состав Российской империи эта модель распространилась и среди духовенства, а позже — и среди крестьян, которых записывали по названию села. Поэтому Пересечанский мог быть и потомком мелкой шляхты, и священником, и просто крестьянином из одноимённого села.

Само название Пересечное, скорее всего, происходит от слова «пересекать» — место на пересечении дорог, рек или границ. Либо от «сеча» — вырубка в лесу, расчищенное для поселения место. В любом случае, корень указывает на ландшафтную особенность: село стояло на перекрестке путей или на месте вырубленного леса.

Интересная деталь: фамилия Пересечанский встречается реже, чем её «украинский» аналог Пересеченский или Пересеченко. Написание через «а» (Пересечанский) чаще фиксируется у носителей из бывших польских губерний, где в топонимах была характерна «а» вместо «е» (сравните: Пересеча, а не Пересечье). Если встретили вариант через «е», это может указывать на более позднюю русификацию фамилии или на запись со слов.

Сословная принадлежность предков-носителей фамилии, скорее всего, была неоднородной. В метрических книгах XIX века Пересечанские встречаются и среди мещан, и среди духовенства, и среди однодворцев (потомков служилых людей). Единой дворянской линии не прослеживается — фамилия «народная», образованная от названия реального села, а не от вымышленного герба.