Основой фамилии Плохенко послужило мирское имя Плоха. Мирское имя Плоха образовано от прилагательного «плохой» со значением «нездоровый, больной», «дурной», «невеселый, мрачный». Скорее всего, имя Плоха относится к числу «охранительных» именований, выполняющих функцию оберега. В данном случае, надеясь иметь здорового, доброго мальчика со счастливой судьбой, родители назвали его Плохой. Согласно другой гипотезе, в основе фамилии Плохенко лежит прозвище Плоха, основой для которого послужило нарицательное «плоха» - «просека для перевеса, для тенет на уток». Можно предположить, что прозвище Плоха относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности основателя фамилии: он мог быть охотником.