Фамилия Побойнев — редкая и неочевидная с первого взгляда. Её основа — глагол «побойнить» или существительное «побойня», но не в современном значении «бойня» (место убоя скота), а в более старом и диалектном. В русских говорах «побойня» означала драку, побоище, а также — реже — место, где бьют лён или треплют шерсть. Человек, получивший прозвище Побойня, мог быть задирой, участником частых драк, либо, наоборот, работником, занятым в обработке волокна. Первая версия правдоподобнее: прозвища, связанные с характером, в крестьянской среде давали чаще, чем по узкому ремеслу.

Суффикс -ев указывает на патронимический тип: Побойнев — буквально «сын Побойня». Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ или мирских имён, нецерковных. По той же модели возникли, например, Победин (от «победа») или Побережный, но Побойнев стоит особняком — его корень агрессивнее и бытовее.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным регионам России, где фиксировались говоры со словом «побойня». Встречается она редко, и в дореволюционных переписях носители могли быть записаны как крестьяне или мещане. Никаких дворянских родов с такой фамилией не известно — это однозначно фамилия из народной среды, без аристократического ореола.

Интересная деталь: из-за созвучия с «бойня» у фамилии могло возникнуть вторичное, ироничное осмысление уже в XIX веке. Но первоначальное прозвище Побойня — это не про мясника, а про человека, который сам был «ходуном» в драке, задиру. Так что предок современного носителя, скорее всего, был не из робкого десятка.