Фамилия Подеряко — редкий случай, когда прозвище застыло в форме, почти не изменившейся за века. В основе лежит украинское или южнорусское слово «подеряка»: так в диалектах называли сварливого, драчливого человека, забияку. Корень тот же, что у «драть», «драка» — человек, который постоянно «дерется», то есть скандалит или лезет в драку. Первый носитель фамилии, скорее всего, получил это прозвище от соседей за неуживчивый нрав.

Обращает на себя внимание суффикс -о. В восточнославянских фамилиях он встречается реже, чем привычные -ов или -ин, и чаще всего закрепляет прозвище в исходной форме, без дополнительной русификации. Подеряко — это не «сын Подеряки», а сам Подеряка, человек, которого так прозвали. Такая модель типична для украинской ономастики, особенно для левобережных и центральных областей. Встречаются параллельные формы — Подеряка, Подерягин, но Подеряко — самая прямая, без посредников.

Фамилия географически привязана к зоне украинско-русского пограничья: Черниговщина, Полтавщина, юг Брянской области, Курская губерния. В списках казацкой старшины XVII–XVIII веков фамилия не засветилась — носители, скорее всего, были из крестьян или мещан. Прозвище не из лестных, но в среде, где ценилась физическая сила и способность постоять за себя, оно могло быть не оскорблением, а констатацией факта.

Есть и вторая, менее вероятная версия: от слова «подряка» — так в некоторых говорах называли плохую, рваную одежду, «подранок». Тогда Подеряко — это неряха, человек в обносках. Но первая трактовка поддерживается большим числом диалектных записей и логикой словообразования: глагольная основа «дер-» с приставкой «по-» чаще даёт значение действия, а не предмета.