В основу фамилии Потанахин легло мирское имя Потаня. Фамилия Потанахин, скорее всего, происходит от нецерковного имени Потаня, производной формы имен Потап и Потамий (в переводе с греческого – «речной»). Согласно другой, менее правдоподобной версии, в основе этой фамилии лежит тюркское прозвище, образованное от слов pot – «морщина» и anac – «взрослый, опытный, умелый». В результате, потомок человека, обладающего именем Потаня, со временем получил фамилию Потанахин.