Фамилия Прилепин, вероятно, ведет свое начало от прозвища Прилепа, которое восходит к аналогичному нарицательному. Прилепой называют то, что прилеплено, прикреплено к чему-либо. Исходя из этого, можно предположить, что Прилепой нарекали ребенка, который не отходил от матери. По другой версии, прозвище Прилепа этимологически связано с глаголам «прилеплять», то есть «приклеивать», «прикреплять». Возможно, прозвище Прилепа относится к профессиональным именованиям, указывающим на род деятельности человека: он мог заниматься работой, которая требовала прилаживания тех или иных деталей к чему-либо. Согласно еще одной, менее вероятной гипотезе, прозвище Прилепа ведет свое начало от топонима Прилеп – такое название носит один из городов в Македонии. Вероятно, предок Прилепиных был его уроженцем. Прилеп – очень древний город, он был основан на руинах древнего города Стиберра, бывшего частью Римской империи. Само название Прилеп образовано от слов «лепить», «липнуть» с помощью приставки при-. Скорее всего, оно имеет значение «прилепиться (к горе, реке, лесу и т. п.)» или «новая окраина села». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Прилепа, со временем получил фамилию Прилепин.