Фамилия Пупичева — редкий случай, когда очевидная основа обманчива. На первый взгляд она звучит как типичная «матрешечная» фамилия: Пупичев, а в женском роде — Пупичева. Но если копнуть глубже, выясняется, что корень здесь не «пуп», как можно подумать, а скорее всего, прозвище или имя Пупич. Суффикс -ич в русских фамилиях встречается нечасто — это отчество, которое указывало на принадлежность к отцу или роду (как сербские Прерадович, Милошевич). В русской традиции фамилии на -ич обычно дворянские или старинные (князья Голицыны, Трубецкие), но в народной среде они могли закрепиться за отдельными семьями, особенно на юге России или в казачьих областях.

Само прозвище Пупич, скорее всего, образовано от слова «пуп» — пупок, центр, середина. В старину «пупом» могли называть младшего ребенка в семье, «пуповину» — как последнего, самого родного. Или же давали прозвище человеку с заметным пупком, либо тому, кто жил в центре села. В словаре русских прозвищ встречаются формы Пуп, Пупа, Пупик — все они фиксировались в писцовых книгах XVI–XVII веков. Пупич — уменьшительно-ласкательная форма от Пупа, как Иванович от Иван, но в роли не отчества, а самостоятельного прозвища.

Фамилия Пупичева — это женская форма от Пупичев. А Пупичев, в свою очередь, означает «сын Пупича», то есть потомок человека по прозвищу Пупич. Модель образования здесь тройная: сначала прозвище (Пупич), потом отчество (Пупичев), и уже от него — фамилия. Такие цепочки характерны для фамилий, возникших в XVI–XVII веках, когда отчества на -ич постепенно превращались в наследственные родовые имена.

Географически фамилия встречается крайне редко. Основной ареал — южные регионы России, особенно Ростовская область, Краснодарский край, а также Украина. В дореволюционных метрических книгах Пупичевы упоминаются среди крестьян и мещан, никакого дворянства за ними не числится. Это говорит о том, что фамилия народная, бытовая, без претензий на знатность.

С точки зрения ударения, правильный вариант — Пу́пичева, с ударением на первый слог. В разговорной речи иногда смещают на второй, но этимологически верно именно так, поскольку основа Пупич имеет ударение на «Пу».