Фамилия Пупукин образована от прозвища Пупука, которое восходит к нарицательному «пуп». В старину пупышами называли толстые украшения и выпуклости на серебряных кубках, пупками - родины. Скорее всего, Пупукой называли повивальную бабку, знахарку, либо человека с большим пупом, т.е. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пупука, со временем получил фамилию Пупукин.