Фамилия Пылинин, на первый взгляд, кажется прозрачной: корень «пыл-» наводит на мысль о пыли, пыльном или горячем, вспыльчивом человеке. Но за простотой скрывается неочевидная история. Суффикс -ин указывает на стандартную русскую модель: «чей?» — Пылинин, то есть сын или потомок Пылины. А вот само имя или прозвище Пылина — редкая форма. Скорее всего, это не уменьшительное от «пыль», а вариант древнерусского нецерковного имени Пыла или Пыля. В старину на Руси так могли назвать ребенка с «горячим», пылким нравом, от глагола «пылать» — гореть, полыхать. В этом случае Пылинин — «сын Пылы».

Вторая версия, более приземленная, связывает фамилию с профессиональным прозвищем. Пыльником или пылиной в некоторых говорах называли мельника, мукомола — того, кто постоянно в мучной пыли. Соответственно, Пылинин — потомок мельника. Такие фамилии от занятий составляли большой пласт русских прозваний, и эта версия не менее правдоподобна, чем версия с именем.

Спорный вариант — связь с географическим названием. В России есть несколько речек и оврагов с названием Пылиха, Пылец, но фамилия Пылинин образована не от топонима с суффиксом -ский, а от личного прозвища, что типично для крестьянской среды центральной России. Потому искать предков стоит не столько на карте, сколько в бытовых занятиях — мельничном деле или в характере. Фамилия редкая, недворянская, и ее носители, скорее всего, происходят из среды вольных или помещичьих крестьян, где прозвище давали метко и без затей.