Фамилия Пылинина — женская форма фамилии Пылинин, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или именем Пылиня. В русской ономастике суффикс -ин указывает на принадлежность: Пылинин буквально означает «сын Пылини» или «человек из рода Пылини». Сама основа — Пылин- — вызывает вопросы, и здесь есть два основных пути объяснения.

Первый и самый очевидный вариант: прозвище Пылиня (или Пылин) могли дать человеку за неопрятность, склонность к пыли, работе в пыльных условиях или за бледный, «пыльный» цвет лица. В говорах «пылить» означало не только поднимать пыль, но и делать что-то быстро, суетливо, отсюда же «пылкий» — горячий, вспыльчивый. Второй, менее вероятный, но не исключённый вариант: корень может восходить к диалектному слову «пыль» в значении «мелкий сор» или даже к имени Пылин (производное от Пылай, Пылка — кратких форм от крестильных имён типа Полиевкт или Палладий). Однако в случае с фамилией Пылинина первая версия — с бытовым прозвищем — выглядит убедительнее, так как она типична для русских фамилий, образованных от характеристики внешности или занятия.

Фамилия Пылинин встречается нечасто, но географически привязана в основном к северным и центральным регионам России: Архангельская, Вологодская, Кировская области, а также Поволжье. Это указывает на её крестьянское происхождение — такие фамилии часто закреплялись за семьями в среде черносошных крестьян или посадских людей, где прозвища передавались по наследству без участия дворянских родов. Суффикс -ин в этой форме (а не -ов) тоже типичен для северных говоров, где притяжательные фамилии от прозвищ на -я были распространены шире, чем в южных областях.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Пылин, Пыльнев, Пыльников — то Пылинина стоит особняком из-за суффикса -ин, который в данном случае не просто притяжательный, а указывает на конкретное лицо: Пылиня. В документах XVII–XVIII веков можно встретить записи «Пылинин сын», что подтверждает модель образования. В современном мире носительницы фамилии Пылинина могут с уверенностью считать, что их предок получил прозвище не за пыль как таковую, а за какую-то яркую черту, связанную с этим словом — будь то профессия (мельник, пекарь, дорожный рабочий), внешность или даже характер.