Фамилия Ратушенко образована по типичной для юга России и Украины модели: к основе прозвища или профессии добавили суффикс -енко, который в XVI–XVII веках закрепился как патронимический (указывающий на происхождение от отца). В буквальном смысле Ратушенко — «потомок Ратуши». Но вот что стоит за этим прозвищем, вопрос неоднозначный.

Самая прямая версия — от слова «ратуша», которое в западнорусских землях и в Речи Посполитой означало городское самоуправление, магистрат. В таком случае прозвище Ратуша могли дать человеку, служившему при ратуше: писарю, глашатаю или сторожу. Однако фамилия звучит скорее как уменьшительная форма — «Ратушенко» могло означать «сын Ратуши», где Ратуша — это уже личное прозвище, возможно, ироничное: так могли назвать бойкого, шумного человека, напоминающего «ратушного» глашатая.

Вторая гипотеза, менее популярная, но имеющая право на существование, — связь с глаголом «ратувати» (спасать, выручать) в украинских и польских говорах. В таком случае прозвище Ратуша мог получить спасатель, тот, кто помогал в беде. Однако эта версия слабее: суффикс -уш- в прозвищах чаще указывает на предмет или должность, чем на действие.

Фамилия Ратушенко распространена в центральных и восточных областях Украины, а также в приграничных регионах России (Курская, Белгородская области). Встречается и вариант Ратущенко — с утратой мягкости, что характерно для некоторых южнорусских говоров. Среди однокоренных — Ратушный, Ратушняк, Ратушко, но Ратушенко стоит особняком именно из-за модели с -енко, которая ясно указывает на «сыновство» и на то, что предок носителя фамилии был известен в своей общине под прозвищем Ратуша.

Сословная принадлежность у Ратушенко не закреплена: среди носителей встречались и казаки, и крестьяне, и мещане. Дворянских корней у фамилии нет — она из народной, «уличной» традиции именования.