Фамилия Сафарайева — женская форма фамилии Сафарайев, и её разбор стоит начать с мужского варианта, чтобы понять корни. Основа фамилии — имя или прозвище Сафарай. Это имя образовано от арабского «сафар» — «путешествие», «поездка» (ср. месяц сафар в исламском календаре). В тюркских языках, особенно у народов Кавказа и Поволжья, суффикс -ай часто придаёт именам ласкательный или уменьшительный оттенок (как в именах Алтай, Бектай). Таким образом, Сафарай можно перевести как «маленький путник» или «тот, кто связан с путешествием», хотя в быту это могло быть просто личное имя.

Фамилия Сафарайев (и её женская форма Сафарайева) характерна для народов, исповедующих ислам, особенно для татар, башкир, кумыков, чеченцев и народов Дагестана. Модель образования — типично русский патронимический суффикс -ев (вариант -ов после шипящих и мягких согласных). В XIX–XX веках, при оформлении фамилий в Российской империи, к тюркским и арабским именам добавляли русские окончания, чтобы вписать их в официальную систему. Поэтому Сафарайев — это «сын Сафарая», а Сафарайева — «дочь (или жена) Сафарая».

Интересная деталь: фамилия нечастая и сохраняет редкое сочетание корня с суффиксом -ай. В отличие от более распространённых Сафаров (от имени Сафар без уменьшительного суффикса) или Сафаргалиев (сложносоставное имя), Сафарайев указывает на конкретную форму имени, которая бытовала в определённых локальных группах. Например, у татар-мишарей или у некоторых дагестанских аулов такие имена с -ай встречались чаще. Если предки носили эту фамилию, они, скорее всего, были мусульманами из сельской местности, и родоначальника звали Сафарай — возможно, его так прозвали за любовь к странствиям или он родился в месяц сафар.