Фамилия Сафрюк — яркий пример того, как украинский суффикс -юк указывает на происхождение от отца или хозяина. В восточнославянской традиции этот суффикс был характерен для Поднепровья и западных регионов Украины: он означал «сын» или «потомок» человека, названного в основе. В основе фамилии лежит имя или прозвище Сафр, которое является народной формой крестильного имени Софроний (от греческого «софрон» — здравомыслящий, благоразумный). В устной речи имя Софроний сокращали: Сафрон, Сафр, а в бытовом общении — Сафро.

Вторая версия, менее распространённая, связывает основу с самоназванием сафр — так в некоторых южнорусских и украинских говорах называли шафран (пряность). Прозвище Сафр могли дать либо торговцу этой дорогой специей, либо человеку с желтоватым оттенком кожи или волос. Однако эта гипотеза слабее: прозвища от названий пряностей встречаются реже, чем производные от канонических имён.

Суффикс -юк в фамилии Сафрюк — типичный для украинской ономастики, но встречается и в белорусских землях, а также у потомков украинских переселенцев в Сибири и на Кубани. В польском языке аналогичный суффикс -uk, поэтому фамилия могла закрепиться и в западноукраинских регионах, входивших в Речь Посполитую. Социальный состав носителей фамилии — почти всегда крестьянство и казачество, поскольку суффикс -юк в XVI–XVIII веках был маркером простого сословия, а не шляхты.

Встречаются также варианты написания: Сафрук, Сафрiюк (с украинской i), а в русских метрических книгах XIX века — Сафрюков (с русифицированным суффиксом -ов). Все эти формы — результат адаптации фамилии к разным языковым средам, но исходная модель остаётся одной: Сафрюк — «сын Сафра», то есть потомок человека по имени Софроний.