Фамилия Самбурин — одна из тех, чьё происхождение лежит на стыке нескольких языковых традиций, и однозначного ответа здесь не дать. Но можно уверенно говорить о двух основных версиях, и обе ведут к прозвищу или имени, которое легло в основу.

Самая вероятная версия — отчество от имени Самбура (Самбуро). Формант -ин указывает на принадлежность: «чей?» — сын Самбуры. Само имя Самбура — редкое, но фиксируется в исторических источниках. Его корни, скорее всего, тюркские: «сан» (число, почёт) и «бур» (мел, известь, а в переносном смысле — крепкий, сильный). В тюркских языках сложные имена с компонентом «бур» (бури) не редкость, они обозначали волка или силу. Таким образом, Самбура могло означать «крепкий, как камень» или «почётный силач». По этой модели образованы многие русские фамилии от иноязычных имён: например, Сабуров (от Сабур/Сабура).

Вторая версия, менее распространённая, но тоже имеющая право на существование, — связь с итальянским топонимом Самбура или фамилией Samburini. В этом случае носитель фамилии мог быть потомком выходца из итальянских земель, который адаптировал свою фамилию под русскую модель с суффиксом -ин. Однако для массового бытования фамилии в России это скорее исключение, чем правило.

С географической точки зрения фамилия Самбурин не является массовой. Она встречается в центральных областях России и на юге, что косвенно подтверждает её связь с тюркскими корнями — зона активных контактов славянского и тюркского населения. Сословно предки Самбуриных могли быть как служилыми людьми (дворянами или однодворцами), так и крестьянами, получившими фамилию по имени отца.

Любопытная деталь: в некоторых говорах слово «самбура» или «самбур» могло означать «сумбур», «беспорядок» или «шум», но это скорее народная этимология, нежели реальный источник фамилии. Ономастика такие случайные созвучия обычно отвергает, отдавая предпочтение антропониму.