Фамилия Саможон — редкая и неочевидная с точки зрения словообразования. Если отбросить суффикс -он, который в русских фамилиях встречается нечасто, остаётся основа «самож». Именно она и вызывает споры.

Самый прямой путь — видеть в основе слово «сам» и корень «жон». Но «жон» в русском языке самостоятельного значения не имеет. Скорее всего, перед нами вариант фамилии, образованной от прозвища, которое закрепилось в южнорусских или украинских говорах. Там «жон» могло быть искажением от «жнец» (жнея) или от «жона» — диалектной формы слова «жена». Тогда «Саможон» — человек, который «сам себе жнец» или «сам себе хозяин-женатый», то есть живущий своим домом без чужой помощи. Прозвища такого типа — «сам-себе-господин» — давали самостоятельным, замкнутым крестьянам.

Другая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование: фамилия могла возникнуть на стыке двух слов — «сам» и «ожог» (диалектное «ожон»). В этом случае прозвище Саможон означало бы «сам себя обжёгший» — человека, который пострадал по собственной неосторожности. Однако эта гипотеза слабее, так как требует допущения о выпадении звука.

Суффикс -он в русских фамилиях типичен для украинского влияния (сравните: Грицон, Петрон). Это указывает на то, что предки носителя фамилии могли происходить с территорий современной Украины или юга России, где фамилии на -он встречаются чаще, чем в северных областях. Встречаемость фамилии Саможон крайне низкая. По открытым данным, она фиксируется в единичных случаях, преимущественно в центральных и южных регионах России. Сословной принадлежности предков по фамилии не определить — прозвище могли дать и крестьянину, и ремесленнику.

Таким образом, фамилия Саможон — это, скорее всего, прозвище самостоятельного человека, который «сам себе хозяин», возможно, связанное с жатвой или домом, закрепившееся в южнорусской среде.