Фамилия Сельницин — одна из тех, что образована от названия места жительства или профессиональной принадлежности, но с неочевидным корнем. Основа здесь — «сельница». В старину сельницей называли не просто жительницу села, а крестьянку, женщину, проживающую в сельской местности. Однако в диалектах, особенно северных и сибирских, у слова было и другое значение: сельница — это деревянное корыто или ларь для хранения муки и зерна, а также мера сыпучих тел. То есть прозвище Сельница мог получить либо человек, торговавший зерном и мукой, либо владелец амбара или мельничного закрома.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Сельницин — буквально «сын Сельницы» или «человек из семьи Сельницы». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я. Интересно, что фамилия не получила широкого распространения и встречается редко, в основном на северо-востоке европейской части России и в Зауралье. Это говорит о локальном бытовании прозвища, скорее всего в среде крестьян-старожилов или однодворцев.

В ономастике есть и другая версия: Сельницин мог быть образован от названия деревни Сельницы или Сельничи. Такие топонимы существовали в Новгородской и Вятской губерниях. Если так, то фамилия — «географическая», то есть её дали человеку, переселившемуся из этого села. Правда, в этом случае ожидалась бы форма Сельницкий, но на практике фамилии на -ин от названий сёл тоже встречались, особенно в простонародной среде.

С точки зрения социального контекста, Сельницины, скорее всего, были государственными или экономическими крестьянами, а не дворянами. В списках помещичьих крестьян XVIII–XIX веков фамилия почти не фиксируется — это косвенно подтверждает её «вольный» или церковно-приходской характер. Сейчас носителей фамилии немного, она не потерялась, но и не стала массовой, сохранив свою диалектную окраску.