Фамилия Синцерова — женская форма мужской фамилии Синцеров. В основе её лежит не имя и не профессия, а географическое прозвище: человека, носившего фамилию Синцеров, скорее всего, прозвали «Синцер» — по названию места, откуда он родом. Такой тип фамилий (на -ов/-ев) типичен для центральной России, где прозвища часто превращались в фамилии без дополнительных суффиксов.

Корень «синц-» — это диалектный вариант слова «синец» или «синьга». В русских говорах «синец» могло означать: 1) растение синюха; 2) рыбу (синец, вид леща); 3) синеватый оттенок чего-либо. Но надёжнее всего связь с топонимом: в Тверской и Псковской областях встречаются деревни с названиями Синцово, Синцево, а в Смоленской — урочище Синцер. Если предок переехал из такой деревни, его земляки легко могли дать ему прозвище по названию родного села — «Синцер» (житель Синцова). Суффикс -ер здесь нехарактерен для русских фамилий и выбивается из стандартного ряда, что говорит о локальном, возможно, западнорусском происхождении.

Словообразовательная модель проста: прозвище Синцер (от названия места) + патронимический суффикс -ов. Фамилия Синцерова, таким образом, буквально означает «дочь/жена Синцерова» (мужская форма — «принадлежащий Синцеру»). Встречается она редко, в основном на северо-западе России (Новгородская, Псковская области). Никаких документальных свидетельств о дворянском происхождении или известных носителях в открытых источниках нет — фамилия осталась в крестьянской среде, что типично для поздних фамилий, образованных от названий мелких деревень.