Фамилия Сирунов — редкий случай, когда основа не лежит на поверхности. На первый взгляд, в ней угадывается тюркский корень «сир» (тайна, секрет), но при более пристальном взгляде версия рассыпается: суффикс -ун- в русских фамилиях почти всегда указывает на действие или признак, а не на абстрактное понятие. Куда вероятнее, что перед нами отчество от прозвища Сирун, а оно, в свою очередь, восходит к глаголу «сиреть» — становиться сирым, то есть бедным, одиноким, осиротевшим. В диалектах слово «сирун» могло означать «сирота» или «бедняк», причём не обязательно в прямом смысле: так могли прозвать человека, потерявшего кормильца, или просто невезучего крестьянина.

Модель образования проста: прозвище Сирун плюс типичный русский суффикс принадлежности -ов. Фамилия отвечает на вопрос «чей?» — сын Сируна. Суффикс -ун в основе встречается нечасто, он придаёт слову оттенок носителя качества (ср. «бегун», «говорун»), что подтверждает: прозвище давали по устойчивой черте или положению, а не по случайному событию.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — там, где диалектное слово «сирый» было в ходу. Встречается она редко, поэтому не стоит искать массовых переселений или знатных родов: это фамилия крестьянского или мещанского сословия, закрепившаяся в одном-двух уездах. В документах XVII–XVIII веков Сируновы могли записываться как Сиротинины или Сироткины, но позже форма стабилизировалась именно с -ун-.

Есть и альтернативное прочтение: в некоторых говорах «сирун» — название растения (синеголовник) или рыбы, но эти версии слабее. Прозвища от названий растений обычно образуются через суффикс -ик (Сируник), а не -ун. Так что основная версия — от «сирый» — остаётся самой убедительной.