Фамилия Сиваконев — редкий пример трёхкорневой русской фамилии, где соединились два прозвища или имени. Первая часть — «Сива» — восходит к прилагательному «сивый», то есть седой, белесый. В славянской традиции Сивой или Сивкой называли человека с седыми волосами, а чаще — лошадь серой масти (отсюда и сказочный Сивка-Бурка). Вторая часть — «конь» — прямое указание на лошадь. Выходит, что прозвище Сивый Конь мог получить либо крестьянин, владевший приметной сивой лошадью, либо человек, которого за что-то сравнивали с такой лошадью — например, за выносливость или цвет волос.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Сиваконев буквально означает «сын Сивого Коня». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ, состоящих из двух слов. Интересно, что в отличие от фамилий вроде Кривошеин или Белоногов, где первая часть — прилагательное, а вторая — существительное в родительном падеже, здесь форма сохранена в именительном: Сива-конь, а не Сиво-коня. Это говорит о том, что прозвище воспринималось как цельное имя, а не как описательная конструкция.

Географически фамилия Сиваконев — большая редкость. Встречается она преимущественно в южнорусских регионах, особенно в Воронежской области и на Кубани, где были сильны традиции казачьего коневодства. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) подобные сложные фамилии с «конём» не единичны: есть Конев, Сивоконев, Сивоконь. Сиваконев, вероятно, возник как вариант Сивоконева, где гласная «а» закрепилась под влиянием акающего произношения: Сивоконь на слух воспринимался как Сиваконь.

Сословно фамилия почти наверняка крестьянская или казачья. Дворянские роды с такой фамилией не известны. Предки носителя фамилии, скорее всего, были конными пахарями или казаками, для которых лошадь была не просто рабочим скотом, а частью прозвищного имени.