Фамилия Смирина — женская форма, но говорят о ней обычно в мужском варианте Смирин. В основе фамилии лежит не имя и не профессия, а прозвище, и это сразу отличает её от массы фамилий на -ин, образованных от крестильных имён (Иван — Иванов — Иванин). Смирин, скорее всего, восходит к древнерусскому слову «смирь» — тихий, кроткий, смирный человек. В говорах «смиря» могло означать не просто спокойного, а того, кто живёт мирно, не ссорится, или, напротив, того, кого «усмирили» — привели к порядку.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Смирин, то есть сын или потомок Смири. Такая модель типична для прозвищ, оканчивающихся на -а/-я: Смиря — Смирин, как Тиша — Тишин, Молча — Молчанов (но тут уже суффикс -ов, что показывает разницу в словообразовании). В некоторых областях, особенно на севере и в Поволжье, фамилии на -ин от прозвищ встречаются чаще, чем на -ов, поэтому география бытования Смириных может указывать на эти регионы.

Стоит упомянуть и менее вероятную версию: связь с топонимом. В России есть несколько деревень с названием Смирино (например, в Тверской и Псковской областях). В таком случае фамилия могла образоваться от названия места жительства, но для этого обычно использовали суффикс -ский (Смиринский). Версия с прозвищем надёжнее: она проще и типичнее для русской ономастики.

Однокоренные фамилии — Смирнов, Смирягин, Смиренский. Но Смирнов образован от полной формы прилагательного (смирный), а Смирин — от краткого прозвища, что реже. В дореволюционных источниках фамилия встречается в купеческих и мещанских списках, но в дворянских родословных её почти нет — Смирины были людьми «простого звания», что подтверждает бытовое происхождение прозвища.