Фамилия Суханин — классический пример того, как русская патронимическая модель «законсервировала» просторечную форму крестильного имени. Основа здесь — Суханя. Это народный, обиходный вариант канонического имени Стефан (от греч. «стефанос» — венец). В русской традиции «ф» часто заменялось на «х»: Степан превращался в Стехан, а ласкательная форма давала Суханю. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Суханин. Другими словами, предок носителя фамилии был сыном человека по имени Суханя (Степан).

Вторая, менее вероятная версия отталкивается от диалектного слова «сухань» или «сухан». В некоторых говорах так могли называть сухого, худощавого или неприветливого человека. Однако эта гипотеза слабее: подавляющее большинство русских фамилий на -ин образовано именно от личных имён, а не от прозвищ с таким корнем. Если бы прозвищная версия была основной, мы бы видели массу фамилий Суханов от более употребительного «сухой», а не от редкого «сухань».

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России, что характерно для имён, прошедших через местные говоры. В некоторых областях Суханю могли производить и от имени Александр (через промежуточные формы Саня — Суня — Суханя), но это уже локальные ответвления.

Примечательно, что фамилия сохранила редкий для сегодняшнего дня вариант имени. Сейчас Стефанов и Степанов в разы больше, а Суханин — как раз тот случай, когда фамилия осталась живым свидетельством того, как звучало имя в крестьянской среде несколько веков назад.