Фамилия Темнекова — женская форма фамилии Темнеков, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Темнек. Самая очевидная версия происхождения основы — от слова «темный»: в древнерусском языке «темнекъ» могло означать человека смуглого, черноволосого или угрюмого, нелюдимого. В говорах «темняк» — это не только мрачный человек, но и невежда, простак, а в некоторых регионах — колдун, знахарь. Словообразовательная модель проста и типична для русских фамилий: суффикс -ов/-ев присоединялся к прозвищу, указывая на принадлежность («сын Темнека»).

Однако есть и второй, менее очевидный вариант. В русских диалектах, особенно на юге и в Поволжье, «темнек» могло быть названием ремесла или занятия — например, человека, который красил ткани или кожи в темные цвета. В этом случае фамилия Темнеков — профессиональная, как Красильников или Чернильников. Подтвердить или опровергнуть эту версию без генеалогического исследования конкретной семьи сложно, но она имеет право на существование.

Географически фамилия Темнекова встречается нечасто, но имеет заметный очаг в Тамбовской и Рязанской областях. Это косвенно указывает на возможную связь с городом Темников (ныне в Мордовии) — в старину «темниковцами» называли выходцев из этого города, а фамилия могла возникнуть как указание на место жительства. В таком случае корень не «темный», а топонимический: Темнеков — тот, кто родом из Темникова. Суффикс -ов в этом случае работает так же, как в фамилиях Москвин, Тверитинов или Казанцев.

Таким образом, у фамилии три равноправных пути происхождения: от личного прозвища по характеру или внешности, от названия ремесла или от места жительства. Выбрать единственно верный для всех носителей невозможно — ответ зависит от истории конкретной семьи.