Фамилия Тоницкая — вариант женского рода, образованный от мужской формы Тоницкий. В основе фамилии лежит топоним: так называли выходцев из села или местечка с названием Тоница, Тоничи или Тоницкое. Такие географические названия встречаются в западной части России, на Украине и в Белоруссии, особенно в зонах бывшего Речи Посполитой, где фамилии на -ский/-цкий были распространены среди шляхты и духовенства.

Модель образования типична для польской и западнорусской ономастики: суффикс -цк- указывает на принадлежность к местности, а окончание -ая — на женский род. В отличие от великорусских фамилий на -ов/-ев, которые часто закреплялись за крестьянами и мещанами, фамилии на -ский/-цкий в XVI–XVIII веках чаще носили дворяне, а также священники, получавшие фамилии по названию прихода.

Корень «тон» может иметь несколько объяснений. Самое прямое — от слова «тоня» (рыболовное угодье, место ловли неводом): Тоницкий — «живущий на тоне» или «владеющий тоней». В говорах «тонь» означала также тонкое, болотистое место — отсюда название деревни на сырой низине. Менее вероятна связь с личным именем Тоня (уменьшительное от Антон) — в таком случае фамилия звучала бы как Тонин, а не Тоницкий.

Встречается фамилия и в варианте Тоніцька (украинская запись), что подтверждает её западнорусское происхождение. В дореволюционных метрических книгах Киевской и Волынской губерний Тоницкие фигурируют как мещане и священнослужители — две основные сословные группы, носившие фамилии на -ский.