Фамилия Труников — яркий пример того, как русская фамилия может хранить память о занятии или прозвище предка, при этом её основа неочевидна на первый взгляд. Вопреки возможной догадке, она не связана с глаголом «трунить» (шутить, насмехаться), хотя такое народное объяснение встречается. Лингвистически надёжнее возводить её к слову «трун» или «труна» — в старых русских говорах так называли тряпку, ветошку, лохмотья. Соответственно, Труником (или Трунником) в диалектах могли прозвать неряшливого человека, оборванца, либо, наоборот, торговца ветошью — старьёвщика. Суффикс -ик здесь указывает на лицо по характерному признаку или роду деятельности, а -ов добавляет значение принадлежности: «сын Труника».

Модель образования типична для русских фамилий XVI–XVII веков: сначала возникло прозвище Труник, затем от него образовалось притяжательное прилагательное Труников, которое закрепилось как фамильное имя. Интересно, что слово «трун» в значении «тряпка» фиксируется в северных и сибирских говорах, что даёт возможную географическую привязку: фамилия могла возникнуть в Поморье или на Урале. Встречается и вариант Трунников — с двойным «н», что усиливает связь с исходным существительным «трунник» (ветошник).

Менее распространённая, но допустимая версия — происхождение от уменьшительной формы крестильного имени Андроник (Андроник → Троник → Труник). В народной речи сложные греческие имена часто сокращались до неузнаваемости. Однако в этом случае фамилия должна была бы звучать как Троников или Андроников, а согласный «у» вместо «о» указывает скорее на диалектную огласовку от «трун». Поэтому версия с прозвищем по занятию или внешнему виду выглядит предпочтительнее.

В отличие от массовых фамилий вроде Иванов или Кузнецов, Труников встречается редко и не имеет широко известных исторических носителей. Это фамилия, которая не «парадная», а бытовая, крестьянская или посадская — она прямо говорит о том, чем человек выделялся в своей среде: либо бедностью, либо неопрятностью, либо особым ремеслом. В дореволюционных переписях она могла записываться и как Трунников, и как Труников, что затрудняет поиск корней, но добавляет колорита: за фамилией стоит не абстрактный предок, а живой человек с конкретной профессией или прозвищем.