Фамилия Трунилин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Прозвище Трунила, вероятно, происходит от глагола «трунить» - «шутить, насмехаться, подшучивать». Таким образом, Трунилой могли прозвать язвительного человека. Согласно другой версии, это прозвище связано со словом «трун», то есть «тряпка, отрепье, лохмотья, ветошь, обноски». Соответственно, Трунилой могли называть и того, кто ходил в старой одежде, старьевщика или скупца. Однокоренные именования встречаются в письменных источниках начиная с XVI века. Веселовского упоминаются: Трун, крестьянин (1545 г., Новгород), Трунец Иван, рыболов (1585 г., Псков) и Григорий Трунов, дворцовый дьяк (1600 г.). Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Трунила, со временем получил фамилию Трунилин. О точном месте и времени возникновения фамилии Трунилин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Трунилин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.