Фамилия Ушенко звучит на украинский лад и образована по типичной для южнорусских и украинских земель модели. Суффикс -енко в этой фамилии — не просто окончание, а главный смысловой маркер. В XVII–XVIII веках в Левобережной Украине суффикс -енко означал «маленький» или «сын» (по аналогии с русским -ович). То есть Ушенко — это буквально «маленький Уша» или «сын Уши».

Основа фамилии — Уш- — восходит к мирскому прозвищу или имени Уш, Уша. В древнерусской традиции прозвища, связанные с частями тела, давали по характерной внешности: человек с большими, торчащими или необычной формы ушами. Такие прозвища были распространены и не считались обидными — скорее, цепкими и запоминающимися. В документах XV–XVI веков встречаются люди с прозвищем Ухо, Ушко, Ушан, что подтверждает эту версию.

Есть и более редкая, но возможная версия: происхождение от тюркского имени Уш (в переводе — «три»). В степных регионах, где русские и украинские крестьяне контактировали с тюркскими народами, такие имена иногда заимствовались и переосмыслялись на местный лад. Однако для фамилии Ушенко эта версия менее вероятна — суффикс -енко указывает на восточнославянскую, а не тюркскую модель.

Географически фамилия Ушенко чаще всего встречается на территории современной Украины, особенно в Полтавской, Черниговской и Сумской областях. В России она расселилась в XIX–XX веках, но остаётся относительно редкой. В реестрах Войска Запорожского и среди казачьих фамилий похожие прозвища (Уша, Ушан) фиксировались нередко — так что предки Ушенко вполне могли быть казаками или крестьянами, получившими фамилию по отцу с характерной внешностью.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Ушаков, Ушанов, Ушков, — то Ушенко стоит особняком: суффикс -енко выдаёт не московское, а малороссийское происхождение. Это не фамилия боярского или дворянского рода, а типичная «родовая» фамилия простого сословия, закрепившаяся в эпоху, когда украинские крестьяне и казаки массово получали фамилии по отцу.