Фамилия Вакушин образована от прозвища Вакуша, в основе которого лежит аналогичное диалектное нарицательное. Так в архангельских говорах называют лягушку. Такое прозвище могло содержать указание либо на физические особенности человека (например, холодные руки и ноги), либо на его место жительства (он жил в болотистой местности). По другой версии, в основе данной фамилии лежит мирское имя Вакуша. Давая младенцу такое имя, как Вакуша, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделено это животное или растение. Так и прозвище Вакуша закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Вакушин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Вакуша, со временем получил фамилию Вакушин.