Фамилия Варакута восходит к аналогичному прозвищу, которое образовано от глагола «варакать» -«небрежно, плохо писать; мазать». Поэтому так могли называть плохого писца или художника, а также вообще плохого работника. Кроме того, в некоторых говорах прозвище Варакута получал неряшливый человек или болтун. Согласно другой, менее правдоподобной гипотезе, в основе этой фамилии лежит нецерковное эрзянское имя Варака («ворон»).