Фамилия Варакута — звонкий пример того, как прозвище, данное за манеру работы или поведения, закрепилось в родовом имени. В её основе лежит глагол «варакать», то есть «небрежно, плохо писать; мазать». Отсюда первое и самое прямое значение прозвища — плохой писец или маляр, который мажет кое-как. Однако в народе редко давали прозвища за одно конкретное ремесло, поэтому Варакутой могли назвать любого плохого, нерадивого работника, а в некоторых говорах — ещё и неряху или пустого болтуна.

Словообразовательная модель здесь редкая и показательная: суффикс -ут(а) характерен для прозвищ, образованных от глагольных основ (ср. «вертута», «заика»). Такие фамилии чаще встречаются в южнорусских и западнорусских говорах, где этот суффикс продуктивен. Именно по этой причине версия об эрзянском имени Варака («ворон») выглядит менее правдоподобной — она не объясняет, откуда в фамилии взялся суффикс -ут-, и опирается на случайное звуковое сходство, а не на живую словообразовательную модель.

Так что, скорее всего, предок носителя фамилии Варакута был человеком, которого в деревне дразнили за небрежность — в письме, в работе или в одежде. Фамилия недворянская, крестьянская или мещанская, и её географическое распространение стоит искать в регионах, где бытовал глагол «варакать» и его производные.