Фамилия Варгин — довольно редкий пример того, как одно и то же прозвище могло возникнуть в разных языковых средах. В основе фамилии лежит прозвище Варга, и у него есть как минимум две версии происхождения, причём обе имеют право на существование.

Первая версия связывает прозвище с диалектным украинским словом «варга» — «губа». Если это так, то Варгой могли назвать человека с полными, крупными губами или, например, с рассеченной губой — то есть прозвище было дано по заметной внешней примете. Такая модель образования прозвищ от частей тела — одна из древнейших в славянской традиции.

Вторая версия ведёт к румынскому слову varga — «прут, палка, розга». Здесь прозвище носило уже не внешний, а характерологический оттенок: Варгой могли прозвать человека сурового, строгого, возможно, даже склонного к наказаниям. Румынское влияние в южнорусских и украинских говорах — не редкость, особенно в регионах, граничивших с Молдавским княжеством.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Варгин — это «сын Варги» или «из рода Варги». Такая модель типична для северной и центральной России, где фамилии на -ин образовывались от основ, оканчивающихся на -а. Интересно, что сама фамилия Варгин встречается не так часто, как её «родственники» Варганов или Варгинский, что может говорить о более локальном бытовании.

Однозначно утверждать, какая из версий верна, сложно: обе лингвистически состоятельны, и выбор зависит от того, в какой именно местности жил первый носитель прозвища. Если он был выходцем из украинских земель — скорее всего, «губа»; если из южнорусских степей или Приднестровья — «розга». Окончательно прояснить историю конкретной ветви Варгиных можно только через генеалогические изыскания с привязкой к конкретному региону.