Фамилия Васненко — типичный пример восточнославянской модели фамилий на -енко, характерной прежде всего для украинской ономастики. Суффикс -енко в XVII–XVIII веках активно использовался для образования фамилий на территории Гетманщины, Слобожанщины и южнорусских земель. Первоначально такие формы указывали на сына или потомка: Васненко — «сын Васьки» или «потомок Василия».

В основе фамилии лежит народная форма имени Василий — Васька, Васня. Уменьшительно-ласкательный вариант Васня встречался в бытовой речи и документах XVI–XVII веков. Имя Василий, пришедшее из греческого (basileus — «царь»), было одним из самых распространённых в православном именослове, поэтому неудивительно, что его производные дали множество фамилий: Васин, Васьков, Васечкин, Василенко. Васненко стоит в этом ряду как вариант с характерным южнорусским и украинским окончанием.

Географически фамилия тяготеет к Черниговской, Полтавской и Харьковской губерниям Российской империи. В переписях XIX века носители Васненко чаще всего записаны как казаки или государственные крестьяне. Ремесленная или сословная привязка здесь отсутствует — фамилия чисто патронимическая, то есть образованная от имени отца.

Интересная деталь: в отличие от более частых Василенко или Ващенко, форма Васненко встречается реже. Это может говорить о том, что в конкретной семье или селе закрепился именно вариант с суффиксом -енко, присоединённым к основе Васн-, а не к полному имени. Возможно, предок носителя фамилии в документах фигурировал как «Васня» — и уже от этого прозвищного имени образовалась фамилия. Споров о происхождении корня нет: все ономасты сходятся на связи с каноническим именем Василий.