Фамилия Вацовский — одна из тех, что образована от имени-прозвища через суффикс -ский, который в славянской ономастике указывал либо на принадлежность к месту, либо на дворянское происхождение. В основе здесь лежит имя Вац — краткая форма от чешского или польского имени Вацлав (Vaclav). Это имя широко известно благодаря святому Вацлаву, покровителю Чехии, и в польском варианте звучало как Венцеслав или Вацлав. Корень «вац» в славянских языках напрямую связан с понятием «больше, более» (от праславянского *vęťьjь), так что имя Вацлав буквально означало «более славный» или «великий славой». Фамилия Вацовский, таким образом, происходит от «Вац» с добавлением типичного польского суффикса -овский, который превращает личное имя в родовое обозначение: «сын или потомок Ваца».

Географически фамилия тяготеет к западнорусским землям, а именно к территории современной Беларуси и восточной Польши. В Российской империи такие фамилии на -ский часто получали шляхтичи или выходцы из духовенства, но не обязательно: крестьяне, переселившиеся в другую местность, тоже могли получить прозвище «Вацовский» как указание на то, откуда они родом (например, из деревни Вацово или Вацево). Стоит отметить, что в польской традиции фамилия могла писаться как Wacowski, а в русской адаптации закрепилась форма Вацовский.

Встречается и менее вероятная версия, что основа «Вац» — это вариант крестильного имени Василий в его уменьшительной форме (Вася, Ваця). Однако для этого нет убедительных лингвистических подтверждений: переход «с» в «ц» в русской среде нетипичен, а вот в польской — естественен. Поэтому чешско-польское происхождение от Вацлава остаётся главной гипотезой.

Сословная принадлежность носителей фамилии могла быть разной. В документах XIX века Вацовские встречаются и среди мещан, и среди однодворцев (особенно на территории Могилёвской и Витебской губерний). Фамилия редкая, не входит в сотни самых распространённых, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если вы носите её, скорее всего, ваши предки — выходцы из западных регионов империи, возможно, с польскими или белорусскими корнями.