Фамилия Вороновене — довольно редкая, и её происхождение можно объяснить двумя основными способами, каждый из которых по-своему логичен.

Первый и самый вероятный путь — от прозвища или нецерковного имени Ворон. В древности, ещё до того, как на Руси повсеместно укоренилось христианство, родители часто называли детей именами животных, птиц или растений. Это был не просто случайный выбор: считалось, что, назвав сына Вороном, ему передают силу, мудрость или долголетие этой птицы. В народе верили, что природа примет такого ребёнка «за своего», а вместе с именем к нему перейдут и полезные качества тотемного животного. От этого имени с помощью типичного русского суффикса принадлежности -ов- и фамильного окончания -ене (форма родительного падежа в некоторых говорах) и образовалась фамилия Вороновене — то есть «из рода Ворона» или «принадлежащий Ворону».

Вторая версия связывает фамилию с географическим названием. На картах России, Украины и Белоруссии и сегодня можно найти множество деревень и сёл с названием Вороново. Если предки человека были выходцами из такого села, их могли прозвать «вороновскими», что со временем закрепилось как фамилия. Суффикс -ене в этом случае указывает на происхождение с определённой территории (сравните: «из Воронова»). Учитывая, что фамилия оканчивается на -ене, а не на более привычные -ов или -ский, можно предположить, что её носители происходят из западных областей России или Белоруссии, где такие формы были распространены.

Таким образом, фамилия Вороновене может хранить память либо о личном имени предка, либо о месте, где он жил. Обе версии имеют право на существование, но первая — с именем-оберегом — встречается в русской ономастике чаще.