Фамилия Якунченкова — редкий случай, когда женская форма оказывается более распространённой, чем мужская. В официальных базах данных (например, в телефонных справочниках и списках избирателей) носительниц фамилии Якунченкова встречается почти вдвое больше, чем мужчин с фамилией Якунченков. Это намекает на то, что фамилия могла закрепиться в среде, где женщины дольше сохраняли родовое прозвище или где мужская линия по каким-то причинам не получила широкого распространения.

Основа фамилии — древнерусское нецерковное имя Якунча. Это уменьшительно-ласкательная форма от имени Якун, которое, в свою очередь, является народным вариантом крестильного имени Иаков (в русском обиходе — Яков). Суффикс -ча в древнерусской антропонимии выполнял ту же роль, что и современные -ка, -енька: он придавал имени оттенок ласки или принадлежности к младшему члену семьи. Таким образом, Якунча — это «маленький Яков» или «Яков, сын Якуна».

Фамилия образована по стандартной патронимической модели: к основе Якунч- добавился суффикс -енк-, характерный для восточноукраинских, южнорусских и белорусских фамилий. Суффикс -енко означает «сын» или «потомок» (буквально: «чей?» — Якунченко). Окончание -а указывает на женский род. Следовательно, Якунченкова — это женщина из рода Якунченко, то есть потомков человека по прозвищу Якунча.

Географически фамилия тяготеет к югу России и востоку Украины. По данным открытых источников, наибольшая плотность носителей — в Белгородской, Курской и Воронежской областях, а также в Харьковской области Украины. Это зона позднего закрепощения и активного переселения, где фамилии на -енко как раз и стали массово фиксироваться в XVIII–XIX веках.

Интересная деталь: в некоторых говорах (особенно курско-орловских) имя Якунча могло быть не уменьшительным, а прозвищным — от диалектного глагола «якунчать» (бормотать, говорить невнятно). Если это так, то фамилия могла возникнуть не от имени, а от прозвища, данного за манеру речи. Однако первая версия — от имени Яков — считается основной и более вероятной, так как имя Якун встречается в берестяных грамотах и летописях XI–XII веков.

Сословного барьера у фамилии не было. Якунченковы могли быть как крестьянами (чаще всего), так и казаками или мещанами. В списках однодворцев (южнорусских мелких землевладельцев) эта фамилия тоже встречается, что говорит о её давней оседлости в пограничных регионах.