Фамилия Якунченков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Якунченков послужило церковное имя Иаков. Мужское крестильное имя Иаков в переводе с древнееврейского означает «второй по рождению». В основу фамилии легла производная форма имени — Якунча (Иаков < Яков < Якунча). Скорее всего, фамилия Якунченков изначально возникла на территории Украины или Белоруссии, о чем свидетельствует характерный суффикс -енко. Со временем, вероятно, род Якунченко переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии путем добавления суффикса -ов. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Якунча, со временем получил фамилию Якунченков. О точном месте и времени возникновения фамилии Якунченков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Якунченков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.