Фамилия Забекина — женская форма фамилии Забекин, и её происхождение напрямую связано с мужским вариантом. Сама основа фамилии Забекин — это, скорее всего, прозвище, образованное от глагола «забекать». В русских говорах это слово означало «заикаться», «запинаться в речи». Человек с таким прозвищем мог получить его из-за особенности речи — заикания или невнятного говорения. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Забекин, то есть сын или потомок Забеки.

Менее вероятная, но допустимая версия связывает фамилию с тюркским корнем «бек» (князь, господин). В этом случае основа «Забек» могла быть вариантом имени или прозвища, означающего «подобный беку» или «защитник». Однако для фамилии Забекина, распространённой в центральной России, первая версия — от «заики» — выглядит более естественной и объяснимой без привлечения иноязычных заимствований.

Фамилия Забекина не относится к числу дворянских или старинных боярских. Скорее всего, её носили крестьяне или посадские люди, у которых прозвища часто фиксировали внешние или речевые особенности. Встречается она преимущественно в Поволжье и некоторых областях центральной России — например, в Нижегородской и Кировской областях, где сохранились архаичные диалектные слова.

Любопытно, что фамилия Забекин не имеет однокоренных «книжных» аналогов (вроде Забелин, образованного от имени Забела), а стоит особняком. Это говорит о том, что её основа — не книжное, а живое, устное прозвище, которое дали человеку в быту. Фамилия редкая, и её носители могут проследить свою родословную, скорее всего, до одного или нескольких локальных родов, а не до обширного сословного слоя.