Фамилия Забекова — женская форма фамилии Забеков. Её основа, судя по всему, тюркская или иранизированная тюркская, а модель образования — типично русская, с суффиксом -ов, указывающим на принадлежность (чей? — Забеков). Разберём корень.

Наиболее вероятная версия: в основе лежит тюркское имя или прозвище Забек. В тюркских языках (особенно в казахском, татарском, башкирском) элемент «бек» означает «князь», «господин», «вождь». Первая часть — «за» — может быть искажённым «заде» (потомок) из персидского, что даёт значение «потомок бека», или же местным диалектным вариантом имени, например, Забир (сильный, крепкий), адаптированным под тюркское произношение. Встречается и вариант, где «Забек» — это сокращённая форма от имени Закирбек (помнящий бека) или Закибек. В любом случае, прозвище или имя указывало на знатное происхождение или уважаемый статус предка — человека, связанного с родом бека.

Менее правдоподобна, но возможна версия от русского диалектного слова «забек» — в некоторых говорах так называли нерасторопного, задумчивого человека (от «бек» — «блеять», «медлить»). Однако эта гипотеза слабая, так как почти все фамилии на -беков имеют тюркские корни, а русских прозвищ с таким суффиксом почти нет.

Фамилия Забекова распространена в регионах с сильным тюркским влиянием — в Поволжье, на Урале, в Казахстане и Средней Азии. Встречается она и у осетин, где «бек» также означает «старший» или «князь», но там корень мог быть адаптирован через иранские языки. Социально предки носителей фамилии, скорее всего, были выходцами из служилых татар, башкир или казахов, которые в XVIII–XIX веках получали русские фамилии при переписях или переходе в крестьянское сословие. Если фамилия осетинская, то предки могли быть из знатных родов, но с утратой приставки «æ» (например, Забеков из Забегъаты).

В написании фамилии встречаются варианты: Забиков, Забеков (мужская форма). Ударение обычно падает на второй слог: Забе́кова.