Фамилия Заболотная образована от прозвища Заболотный. Так в старину называли человека, жившего «за болотом» — на отшибе, за топким или сырым местом. Прозвище указывало на географию поселения: предок носителя фамилии обитал по ту сторону болота, за ним, и это становилось его отличительным признаком. В русских говорах слово «заболотье» означало местность за болотом, а «заболотный» — живущий там. Со временем прозвище закрепилось как фамилия по модели притяжательных прилагательных с суффиксом -ый, типичной для восточнославянской ономастики. Потомок человека по прозвищу Заболотный получил фамилию Заболотная, которая в женском роде сохранила ту же основу.

Фамилия встречается в разных регионах России, особенно в зонах с обилием болот — на северо-западе, в Полесье, в центральных областях. В украинских и белорусских землях распространён вариант Заболотный, а русская форма Заболотная нередко фиксируется у потомков выходцев из этих краёв. Интересно, что в некоторых говорах прозвище могло иметь ироничный оттенок: «заболотным» дразнили нелюдимого или отсталого человека, но основное значение оставалось топографическим. Фамильный суффикс -н- указывает на принадлежность к месту, что роднит её с другими локативными фамилиями вроде Заозёрный, Заречный или Задорожный. В отличие от них, Заболотная реже встречается в дворянских родословных — чаще её носили крестьяне и казаки, селившиеся на окраинах, у непроходимых топей.