Фамилия Заграцкий — одна из тех, чей корень лежит не в церковном календаре, а в географическом названии или прозвище, связанном с местностью. Основа здесь — «заград-» или «заграц-», и самый прямой путь к её значению лежит через слово «заграда» (устаревшая форма слова «ограда», «забор») или глагол «заградить» — перегородить, преградить путь. Соответственно, прозвище Заграда или Заграц могли дать человеку, который жил за оградой, за забором, либо тому, кто возводил эти ограды — строителю, плотнику. В русских говорах «заграда» означала также запруду, плотину, что указывает на возможную профессию мельника или того, кто следил за водными преградами.

Суффикс -цк- (в форме -ский) — классический для фамилий, образованных от названий географических объектов или прозвищ с помощью притяжательного суффикса. Модель «прозвище + -ский» характерна для польской, украинской и западнорусской традиции, где такие фамилии часто получали дворяне или шляхта, владевшие землёй. Однако Заграцкий мог возникнуть и у простого человека, получившего прозвище от места жительства: например, «Заградский» — тот, кто из-за заграды, из-за ограды. Со временем «г» в корне могло перейти в «ц» под влиянием мягкого произношения или диалектных особенностей.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: от географического названия. В Беларуси и на западе России встречаются деревни с названиями вроде Заградье, Заград. Если предок происходил из такого села, его могли записать как «Заградьский», что со временем упростилось до Заграцкий. В пользу этой гипотезы говорит распространённость фамилии среди белорусских и украинских родов, где суффикс -ский часто указывает на шляхетское происхождение, но не обязательно — так могли называть и крестьян, переселившихся в другую местность.

В документах XVII–XVIII веков фамилия не фиксируется, что характерно для поздних прозвищных образований. Скорее всего, она оформилась в XIX веке, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам или месту жительства. Встречается она редко, сосредоточена в основном в западных регионах России, а также в Беларуси и на Украине. Носители фамилии Заграцкий, судя по всему, не принадлежали к высшей знати, а были либо ремесленниками, связанными со строительством, либо крестьянами, получившими прозвище от места своего жительства — «за оградой» или «у запруды».