Фамилия Запаро — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа, судя по всему, не имеет прямых аналогов в русском обиходе, что заставляет искать корень либо в профессиональном прозвище, либо в иноязычном влиянии.

Скорее всего, в основе фамилии лежит старое украинское или южнорусское слово «запара» — так называли кипяток, которым запаривали корм скоту или заваривали чай. В этом случае Запаро — это прозвище человека, который либо готовил запару, либо, в переносном смысле, был горячим, вспыльчивым. Суффикс -о в фамилиях такого типа (как Тягнирядно, Непийвода) характерен для украинской ономастики: он превращает целую фразу или прозвище в фамилию без дополнительных окончаний. Таким образом, Запаро могло означать «тот, кто делает запару» или «запарщик».

Менее вероятна, но возможна связь с глаголом «запарить» в значении «замучить работой» или «загнать» (лошадь). Тогда прозвище давали человеку, который работал до изнеможения или, наоборот, загонял других. Однако эта версия слабее: глагольные прозвища в форме повелительного наклонения (типа «Запари») в русских фамилиях встречаются реже, чем именования по роду занятий.

Географически фамилия тяготеет к югу России и востоку Украины. В современных базах Запаро встречается единично, что говорит о её локальном бытовании: возможно, она возникла в одном селе или хуторе и не распространилась широко.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Запарин, Запаров, — то Запаро стоит особняком: она избежала стандартной русификации через суффиксы -ов/-ин и сохранила исходную украинскую форму. Это указывает на то, что предки носителя фамилии, вероятно, долго жили в среде, где украинские модели словообразования были нормой, и не меняли фамилию под канцелярский стандарт Российской империи.