Фамилия Запарова — женская форма фамилии Запаров, и её разбор стоит начать с вопроса, на который не всегда можно ответить однозначно: от какого слова образована основа? В русских фамилиях суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — сын Запара), поэтому ключ к происхождению — прозвище или имя Запар.

Самая прямая версия связывает Запара с глаголом «запарить» или существительным «запар». В диалектах запаром называли кипяток, крутой отвар, а также процесс запаривания кормов для скота. Прозвище Запар могли дать человеку, который работал на крупяном или пивоваренном производстве, где зерно запаривали, либо тому, кто готовил корм для лошадей или скота. В крестьянском быту это занятие было распространённым, и фамилия могла закрепиться за целым родом работников или хозяев такого дела.

Вторая, менее очевидная гипотеза — связь с тюркским или монгольским именем Запар (вариант Зафар), что значит «победа». В таком случае фамилия указывала бы на предка-мусульманина, чьё имя русифицировали через добавление суффикса. Однако для фамилии Запаров эта версия менее вероятна: в русских документах форма «Запаров» встречается в основном в центральных и северных губерниях, где тюркские имена были редкостью.

Суффикс -ов типичен для великорусских фамилий, особенно в северных и поволжских регионах. Если судить по географии, Запаровы чаще всего фиксировались в Вологодской, Костромской и Вятской губерниях — в зоне развитого льноводства и скотоводства, где запаривание кормов было обыденным делом. Таким образом, наиболее правдоподобно, что фамилия произошла от прозвища по ремеслу или хозяйственной работе.

Редкость фамилии делает её особенно ценной для носителя: в отличие от массовых Ивановых или Кузнецовых, Запаровы сохранили связь с конкретным, узким промыслом или диалектным словом, которое уже вышло из обихода.