Фамилия Заполин образована от прозвища Заполя. В его основе лежит прилагательное «запольный» — по словарю В. Даля, «лежащий за полем или за полями, за пашнями, далее них». Так могли назвать человека, жившего на окраине села, за дальним полем, или владельца участка на отшибе. Есть и бытовое значение слова «заполье» — задняя половина избы, иногда отделенная перегородкой, стряпная, казенка. В этом случае прозвище Заполя мог получить тот, кто жил или работал именно в этой части дома.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Заполин буквально означает «сын Заполи» или «человек из рода Заполи». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или имен, оканчивающихся на -а/-я.

Прозвище Заполя не было широко распространено, что делает фамилию относительно редкой. Она встречается в центральных и северных областях России, где традиционно сильны диалектные слова, связанные с земледелием и устройством крестьянского дома. В некоторых говорах «запольный» означало также «запасной» или «находящийся в отдалении», что могло добавить прозвищу дополнительный оттенок.

Стоит учитывать, что процесс формирования фамилий был длительным и не всегда привязан к одной местности. Точное время и место возникновения фамилии Заполин можно установить только в рамках серьезных генеалогических изысканий, однако её основа — конкретное, понятное прозвище, связанное с бытом и укладом жизни.