Фамилия Запрудских, на первый взгляд, кажется простой по смыслу, но её происхождение скрывает неожиданный поворот. Самая очевидная версия — от слова «запруда», то есть плотина, преграда на реке. Однако фамилия образована не через суффикс принадлежности (-ов/-ев), а через окончание -их/-ых, типичное для северных и сибирских говоров. Такая модель — «чей?» — указывает на целую семью или род: Запрудских буквально означало «из дома Запруды» или «дети Запруды». То есть прозвище Запруда мог получить не тот, кто строил запруды, а, скорее, человек с характером «плотины» — упёртый, стойкий, или же тот, кто жил у самой запруды.

Есть и другой, менее очевидный вариант. В некоторых диалектах «запрудой» называли не только плотину, но и затор, препятствие, а также — в переносном смысле — медлительного, «запруженного» человека. Но правдоподобнее всё же географическая привязка: фамилия могла возникнуть от названия деревни или урочища Запруда, Запрудное. Такие топонимы встречаются по всей России, особенно в центральных областях и на Русском Севере. Тогда предок носителя фамилии был выходцем из Запруды, а его потомки стали Запрудскими — по месту, откуда пошёл род.

Особенность фамилии — её «северный» суффикс. Если бы предок жил в южных или центральных губерниях, скорее всего, фамилия звучала бы как Запрудов или Запрудцев. Форма на -их/-ых (Запрудских, Запрудных) типична для Вологодской, Архангельской, Вятской губерний, а также для Сибири, куда переселенцы принесли этот говор. Таким образом, фамилия не столько указывает на занятие, сколько на местность и на то, что род был крепким, оседлым — «запруженным» на одном месте.

Стоит учитывать и возможную путаницу с фамилией Запрудский (через -ий). Форма Запрудских — это русифицированный вариант, где окончание -их/ых заменило польское или украинское -ий (Запрудский). Встречаются обе версии, но Запрудских — более народная, «своя», без книжного налёта.