Фамилия Завгороднюк — один из тех случаев, когда географическое положение предка застыло в прозвище, а затем и в фамилии. Её основа — украинское слово «завгородній», то есть «тот, кто живёт за городом», за его чертой. В славянской традиции такие прозвища давали крестьянам, селившимся на выселках, за крепостными стенами или за околицей. Человека, чей дом стоял на отшибе, называли Завгородним, а его потомки получали фамилию с характерным украинским суффиксом -ук/-юк, который означает «сын» или «потомок». Таким образом, Завгороднюк — это буквально «сын того, кто живёт за городом».

Суффикс -юк (вместо более распространённого в западных регионах -ук) указывает на происхождение фамилии из юго-восточных областей Украины — Запорожья, Полтавщины, Слобожанщины. В этих краях фамилии на -юк особенно типичны для казацкой среды и мещанства. Интересно, что в русском языке схожая модель дала бы фамилию Загороднев или Загороднов, но украинский вариант сохранил более архаичную форму с приставкой «зав-» вместо «за-». В старых документах встречается и написание Завгородний — это первоначальное прозвище, от которого и пошёл род.

Этимология прозрачна, но есть и тонкость: «город» в малороссийском говоре часто означал не крупный населённый пункт, а огороженное место — крепость, укреплённый двор или просто огороженный тыном посёлок. Поэтому Завгороднюк мог быть жителем не столько пригорода в современном смысле, сколько хутора за оградой казацкого зимовника или за стенами городка. Фамилия не элитарная и не крепостническая — она из среды свободных земледельцев и казаков, которые осваивали окраины земель.

Других версий происхождения, заслуживающих внимания, нет. Связь с каким-либо редким ремеслом или личным именем здесь не прослеживается: корень «город» в этой фамилии работает исключительно как топографический указатель. Сравните с однокоренными Загородний, Загороднов, Загоруйко — все они описывают положение дома, а не занятие человека.