Фамилия Заволотько — редкий пример восточнославянской фамилии, в которой географический корень соединился с уменьшительным суффиксом украинского типа. Основа «заволоть» восходит к слову «волоть» — так в древнерусских и украинских говорах называли колос или метёлку растения. В «Словаре живого великорусского языка» В. И. Даля «волоть» — это стебель, былинка, а также верхушка с семенами. Соответственно, «заволоть» могло означать то, что находится за колосом, за стеблем, или же прозвище человека, который жил «за волотью» — за полем, за жнивьём.

Суффикс «-ко» типичен для украинской и белорусской ономастики. Он образует фамилии от прозвищ и имён, придавая им уменьшительный или принадлежный оттенок. В данном случае Заволотько — это, скорее всего, потомок человека по прозвищу Заволоть. Если разобрать модель: корень «заволоть» + суффикс «-к(о)». Такая конструкция характерна для фамилий, которые закрепились на территории современной Украины, особенно в центральных и северных областях, где распространены фамилии на «-ко»: Шевченко, Ткаченко, Заболотный — и Заволотько стоит в этом же ряду.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с топонимом Заволотье. В России и Беларуси есть несколько деревень с таким названием — от слова «волок» или «волоть» в значении «лесная чаща, заросль». Житель такой местности мог получить прозвище Заволоть, а его дети — фамилию Заволотько. Однако против этой версии говорит то, что фамилия встречается редко и не привязана к какому-то одному региону.

В современных базах данных Заволотько фигурирует в основном на Украине — в Полтавской, Черкасской, Киевской областях, а также в южных регионах России, куда переселялись украинцы в XIX—XX веках. Сословной принадлежности предков установить почти невозможно: фамилия не дворянская, не купеческая, скорее крестьянская или казацкая. Учитывая украинский суффикс, наиболее вероятно, что первый носитель был человеком, которого прозвали Заволоть за место жительства или за особенность внешности — скажем, худой, высокий, похожий на колос.