Фамилия Заярская — типичный пример «географической» фамилии, образованной по модели, характерной для польской, украинской и белорусской шляхты, а затем и для духовенства. В основе лежит топоним — название населённого пункта Заярье или Заяр. Таких мест в Восточной Европе немало: деревни с корнем «яр» (овраг, крутой берег, обрыв) встречаются от Смоленщины до Черниговщины. Приставка «за-» указывает на положение за этим оврагом или за речным яром. Человек, живший «за яром», получал прозвище Заяр, а его потомки — фамилию Заярские.

Суффикс -ск- говорит о дворянском или, шире, привилегированном происхождении носителя. В Речи Посполитой, а затем и в Российской империи фамилии на -ский/-цкий закреплялись за землевладельцами, получившими именование по своему поместью. Однако не стоит думать, что все Заярские — потомки аристократии. С XVIII века этот суффикс активно перенимали крестьяне и мещане, стремившиеся «облагородить» звучание, а также семинаристы — им часто давали фамилии по названиям сёл и храмов.

Мужская форма — Заярский — встречается заметно чаще женской, что логично: женщины в документах фиксировались по мужу или отцу. Сама основа «яр» в славянской ономастике продуктивна: отсюда же фамилии Яров, Ярцев, Заяров. Но Заярский — не отчество и не прозвище по профессии, а именно указание на место. В этом её отличие: она не говорит о характере или ремесле предка, а сообщает, откуда он родом — из-за оврага, из-за кручи.

С точки зрения ударения, в современном русском языке фамилию чаще произносят с ударением на второй слог: Зая́рская. Хотя в диалектах возможны варианты с ударением на последний слог, по аналогии с польским произношением. В старых метрических книгах можно встретить написание через «ѣ» — Заярская, что указывает на древнюю этимологическую связь с «яром» (от общеславянского *jarъ — «крутой берег, обрыв»).