Фамилия Зайдуллина — яркий пример того, как тюркские народы, принявшие ислам, усвоили арабскую ономастическую традицию. В основе фамилии лежит составное мужское имя Зайдулла, которое образовано от двух арабских корней: «Зайд» (Заид), означающего «дар, прибавление, подарок», и «Улла» (от «Аллах» — Бог). Имя Зайдулла переводится как «подарок Аллаха», «дар Божий». Такие имена с компонентом «-улла» («раб Аллаха», «милость Аллаха» и т.д.) были широко распространены среди мусульман Поволжья, Приуралья и Средней Азии, особенно у татар и башкир.

Фамилия образована по русской патронимической модели с суффиксом -ин. В русском языке суффикс -ин присоединяется к основам на -а/-я, поэтому от имени Зайдулла закономерно возникла форма Зайдуллин (чей? — сын Зайдуллы). Женская форма Зайдуллина — это вариант той же фамилии, указывающий на принадлежность к роду.

Процесс закрепления фамилий у татар и башкир завершился в основном к началу XX века. До этого люди часто обходились только именем и отчеством или прозвищем. Поэтому фамилия Зайдуллина фиксирует не профессию или место жительства, а религиозно-значимое имя предка, что типично для мусульманских семей, где имя давали с надеждой на божественное благословение.

Географически фамилия чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях, а также среди татарской диаспоры в других регионах России. Встречаются варианты написания: Зайдуллин, Зайдуллаев (у народов Средней Азии) — в зависимости от местных традиций оформления отчества. Точное место и время возникновения конкретного рода Зайдуллиных можно установить только через генеалогическое исследование, но культурный корень фамилии очевиден: это имя-пожелание, данное ребенку как знак того, что его появление в семье считали высшей милостью.