Фамилия Зайковы (в мужском роде — Зайков) образована от мирского имени Зайко, которое, в свою очередь, восходит к существительному «заяц». В дохристианской традиции имя Зайко давали ребёнку с пожеланием, чтобы природа приняла его как своего, а сам он перенял от зверька проворство, ловкость и жизненную энергию — заяц у славян символизировал молодую, ярую силу. Модель образования проста: к основе Зайк- добавили типичный русский суффикс принадлежности -ов, означающий «сын Зайка» или «потомок Зайка».

В документах фамилия фиксируется с XVI века. В 1537 году в Костроме жил Афанасий Зайков. В 1623 году в деревне Бигичи на реке Колве упомянут крестьянин Гаврилко Захаров сын Зайкова. На Среднем Урале фамилия известна с XVII века: перепись 1680 года застала в деревне Бабиновой на реке Нейве (Невьянская слобода) четырёх братьев Зайковых — Ефрема, Степана, Емельяна и Тимофея Сидоровичей. Тогда же в Ирбитской слободе значилась деревня Зайкова, а в Красноярской слободе Камышловского уезда — крестьянин Епифан Иванович Зайков. Предком крестьян Зайковых из деревни Арамыльской мог быть Иван Агафонович Зайко из Беляковской слободы.

Среди известных носителей — Лев Николаевич Зайков (1923–2002), советский государственный и партийный деятель. О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно, но ясно одно: она образовалась по живой народной модели и прошла долгий путь от мирского имени до устойчивой фамилии, сохранив в основе древнее славянское прозвище.