Фамилия Жигарина — женская форма фамилии Жигарин, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем Жигара. Сама основа «жигара» в русских говорах многозначна, но почти всегда отсылает к человеку с живым, беспокойным или даже вздорным характером. В словаре Владимира Даля «жигара» — это «бойкий, резвый, непоседливый человек», а также «плут, пройдоха». В некоторых регионах так называли задиру или сварливого человека. Таким образом, родоначальник Жигариных, скорее всего, получил это прозвище за свой нрав.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Жигарин — «сын Жигары». Это одна из древнейших моделей, широко распространённая в северных и центральных областях России. Фамилия могла возникнуть независимо в разных местах, но особенно часто она встречается в архангельских и вологодских говорах, где слово «жигара» было хорошо известно. Там же бытуют однокоренные фамилии Жигалов, Жиганов, Жигарёв, образованные от тех же корней, но с другими суффиксами.

Интересно, что в некоторых диалектах «жигара» означало не только человека, но и «огарок свечи» или «головешку». Это вряд ли стало бы прозвищем человека напрямую, но могло дать фамилию по прозвищу ремесленника, работавшего с огнём, например, кузнеца или стеклодува. Однако основная версия — характерная черта поведения.

Встречается и вариант написания с буквой «ы» — Жыгарин, что характерно для южнорусских говоров с фрикативным «г» и особым произношением. Но в литературной норме закрепилась форма через «и». Фамилия не относится к дворянским или аристократическим, её носители — в основном крестьяне и мещане из северных и центральных губерний Российской империи.