Фамилия Жилкинский образована от прозвища Жилка. Оно ведет свое начало от нарицательного «жила» - «подземное родниковое русло с протекающей по нему водой», «скупой, жадный человек». В таком случае Жилкой могли именовать сильного, крепкого, выносливого человека. В старину Жилкой обычно называли уездных дворян, которые были на воинской службе и временно жили при царском дворе. Соответственно, прозвище отражало как род занятий, так и социальное положение родоначальника Жилкинских. Со временем род Жилкинских переехал на территории Украины или Белоруссии, где и произошла трансформация фамилии путем добавления суффикса -ский.