Фамилия Жолобко происходит от прозвища Жолоб. В основе лежит слово «жёлоб» — «борозда, длинная и узкая впадина, большей частью для стока воды», как его трактует словарь Владимира Даля. Скорее всего, прозвище было профессиональным: так могли назвать человека, который копал сточные канавы или делал деревянные желоба для воды. Но есть и другая версия — прозвище могло закрепиться за высоким и худощавым человеком, напоминающим формой вытянутый жёлоб.

Суффикс -ко в фамилии указывает на украинское или белорусское происхождение. В этих языках -ко — типичный патронимический суффикс, означающий «сын такого-то» или «потомок». То есть Жолобко буквально понималось как «сын Жолоба». Такая модель словообразования характерна для восточнославянских фамилий, особенно распространённых на территории современной Украины и юго-запада России.

Интересно, что фамилия сохранила старую орфографию корня: в исходном слове «жёлоб» буква «ё» под ударением, а в фамилии пишется «о» — Жолобко. Это не ошибка, а историческое отражение произношения, когда в безударной позиции звук редуцировался и закрепился на письме как «о». Такая особенность встречается во многих украинских фамилиях, образованных от слов с «ё».

Встречается фамилия в основном на Украине, особенно в центральных и восточных областях, а также среди потомков переселенцев в России. По социальному составу носители чаще всего относились к крестьянскому или казачьему сословию — прозвища ремесленников и людей с заметной внешностью были обычным делом в этих средах.